经历不明原因的试管婴儿失败（反复移植失败），或者2次以上的流产的夫妻，并且不是子宫因素、传染病、基因等问题引起的，可能是由于免疫问题导致。研究表明，移植胚胎和母亲的免疫系统之间复杂的关系对成功受孕至关重要。引起流产或者重复生化妊娠的原因可能也会导致反复着床失败，一般发生在怀孕初期。在这些案例中，医生针对子宫、精子、传染病以及其可能的因素，还有遗传基因问题（如：人类染色体核型分析）做彻底的调查研究，并且也将努力找到发表任何免疫或凝血问题。