移植囊胚并不是说选择自然周期最好，也可以选择人工周期，要看女性的身体情况而定。只不过，选择自然周期的着床率相对较高、刺激相对少等等。另外，自然周期的囊胚移植最佳时间要根据月经周期规定，如果规律就是自然周期移植，一般排卵后三天或者五天就可以了。
首先，囊胚移植采取自然周期的方案在于自然周期内移植，和正常怀孕的过程是一样的，这样移植之后胚胎的着床成功率会相对较高
其次，从用药方面来讲，自然周期的用花量也比人工周期少，这对人体的刺激也会相对较小。
最后，女性的激素水平会随着移植后胚胎生长发育情况而自行分泌，女性体内的雌激素、孕激素、HCG水平是正常的，不会影响到胚胎的发育。
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