胚胎刚着床的时候孕酮是不稳定的，整个孕期都是动态变化，而雌二醇一般是不会下降，基本上维持在正常范围之内。从临床上来看，孕酮下降其实是和胚胎发育、卵巢功能失调、胰岛素抵抗等脱不开关系;相反，雌二醇会随着孕期的胚胎生长发育而不断升高。如果出现了雌二醇和孕酮同时降低的情况，那么就要注意是否出现流产的情况。
1、如果胚胎发育不好对雌激素的促进作用就减弱，使得孕酮降低，所以怀孕初期孕酮降低的最主要原因是胚胎发育不好
2、由于有肾上腺或者甲状腺功能的失调，影响卵巢的功能，使得卵巢发育有障碍，孕酮含量比较低。
3、胰岛素抵抗的作用或者多囊卵巢综合征，也会造成黄体功能欠缺，这样孕酮可能就会比较低。
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